蛋白质芯片技术又称蛋白质阵列，是指将大量已知的蛋白质固定在经过化学修饰的固相载体上。在保留蛋白质理化性质的基础上，将蛋白质与载体表面结合，然后通过激光扫描系统或感应耦合装置获得相关图像。然后用专门的计算机软件分析图像和定性定量结果。Howell等人利用俗称软蚀刻的微接触印刷技术，制作了可以检测大肠杆菌O157∶H7和沙门氏菌肾细菌的微阵列。结果表明，该芯片与其他有害微生物的交叉反应较少，检测浓度为7×107cfu/ml，检测时间为40min，是一种有效的微生物检测方法。
方震建立了大肠杆菌O157的检测方法
H7液体蛋白芯片法。通过绘制检测曲线，将该方法和以H2O为溶剂的液相芯片法分别应用于实际牛肉样品的检测。将该方法与细菌分离培养的阳性检出率进行比较，阳性检出低浓度为103cfu/ml，检测下限为100 cfu/ml。与18种肠道细菌无交叉反应，特异性好；实验重复三次，批间变异系数为7.61，重复性好；用该方法检测牛肉样品中人工添加的细菌，阳性低浓度可检测为0.5 cfu/ml；用该方法检测154份实际牛肉样品，19份呈阳性，16份细菌培养呈阳性。蛋白质芯片技术是一种具有高特异性、高灵敏度、高通量、良好重复性， 适用性强，适用范围广，小型化。在生命科学的各个研究领域都有很好的发展前景，但和基因芯片技术一样，检测成本高，发展还不成熟。
纳米金标记技术
纳米金标记技术是指直径为1 nm-100 nm的微小金颗粒，具有较高的电子密度、介电特性和催化作用，可与多种生物大分子结合而不影响其生物活性。近年来，基于纳米金标记的快速检测研究已广泛应用于有害微生物的检测，检测的微生物种类繁多。通过处理纳米金颗粒的表面特性，在纳米金颗粒表面标记特定的寡核苷酸探针，国内外科技人员开发了一种新的微生物检测系统。
采用氨基偶联法将多克隆抗体固定在传感器表面，以金纳米粒子标记的大肠杆菌O157∶H7多克隆抗体作为二抗。采用双道表面等离子体共振传感器夹心法检测大肠杆菌O157∶H7。SPR直接法的检出限为103cfu/ml，线性范围为103 cfu/ml-109 cfu/ml。金纳米颗粒增强夹心法的检出限为10cfu/ml，线性范围为10 cfu/ml-1010 cfu/ml。灵敏度提高了100倍，检测范围更宽，检测时间缩短，选择性和重现性更好。该技术具有简单、快速、灵敏度高、特异性强、价格低廉、样品要求少等优点。适用于现场筛选，在饲料检测中具有广泛的应用价值和发展前景。
目前，生物领域的专家通过对微生物快速检测的深入研究，开发出了一系列技术，包括ATP荧光检测器、多功能微生物荧光检测器、微生物实时光电检测系统、纸片法等。这些对食品中有害微生物的快速检测技术，未来也可以用在饲料中。这些方法的应用将为饲料安全提供有力保障，促进我国饲料工业的持续健康发展。下面重点介绍两种常用的有害微生物快速检测设备。
快速微生物检测系统
高性能便携式微生物检测仪综合了培养皿法、酶法、免疫法、基因法等多种检测方法的优点，具有方便、操作简单、检测快速、灵敏度高、特异性强、消耗成本低、可定性半定量测定等优点。
快速检测目标:活菌总数、大肠菌群、大肠杆菌、肠杆菌科、绿脓杆菌、李斯特菌、肠球菌、产气荚膜梭菌、硫代亚硫酸梭菌、霉菌(、酵母菌、军团菌等。)可以定量检测。
快速检测产品应用广泛，可用于食品、饲料、医药、水质、空气微生物检测等多个领域，可检测固体、液体、气体、糊状、浆状等样品。易于使用:一个便携式系统可以完成采样、实验、后处理等。，没有各种检测仪器。操作简单:检测样品只需1ml或1g，无需预处理，只需3步即可完成操作。灵敏度高:可检测1cfu数量级的目标微生物，符合国内外微生物检测标准。特异性高:特异性高达99.999%， 这消除了由非靶微生物引起的实验干扰。高精度:100%定量分析是可能的。检测数量:8个插槽可同时提供8个不同的实验和13个不同的标准培养环境。快速检测:10分钟即可得出检测结果，可用于现场检测。智能高:能自动控制孵育温度和孵育时间，并能自动生成实验报告。全自动:独立连续检测并记录瓶内微生物数量。
将激光扫描合成成像技术与活细胞荧光酶标记技术相结合，成功研制了快速RDI微生物检测仪。该仪器可在1.5小时内快速计数可过滤样品中的微生物和原虫，适用于食品、饲料、化妆品和制药行业。其特点是:只检测活细胞数，激光扫描后自动读取整个滤膜，速度极快，无需增菌，90-90—l00min内即可出结果；可以选择荧光显微镜连接仪器，自动定位观察可疑微生物。灵敏度:1可检出微生物或原虫；检测范围:1-5000个细胞。