关于微波消化器的微波化学污水处理技术存在“争议”。
微波化学废水处理技术的基础是“性分子理论”。外界微波场可使这些分子因趋向而高频振荡，消耗能量并产生热量。物质在微波场中是否吸收波及其吸收强度与其电性质有关。
实验表明，单位体积材料吸收的微波功率Pa与电场强度E、材料损耗角tgδ的正切和频率f成正比..物质在微波场中吸收的微波能量转化为热能，所以Pa是单位时间内单位体积物质产生的能量。与物质的介电常数和介电损耗有关的量，物质的介电常数和介电损耗与当时的其他因素有关。
1.消化池不均匀地放置在空腔中。
微波消化器的微波均匀分布在空腔内，但微波具有穿透厚度。如果主控罐周围有两个消化器，腔体本身有六个反射面，来自两个反射面的微波被其周围的两个消化器吸收，那么主控罐吸收微波的功率减少了1/3。
第二，消解罐中的溶剂不一致。
由于每种酸、每种溶剂的微波吸收效率不同，在相同条件下，部分溶剂的微波吸收效率较高，导致消解过程中与主控罐温度不一致。如果高于主控罐，就会产生腹泻压力。例如，主控在空白中使用蒸馏水，使得蒸馏水具有吸收微波的高效率。同等条件下，主控在170度的时候，蒸馏水的温度已经过了260度。
三、微波消解系统采用内置Pt100铂电阻控温，可实时监控温度高达300℃，控温精度0.5℃。性能稳定，经久耐用微波消解系统采用直接接触式压力测量方式，压力真实准确，实时监测可达900psi，控制精度0.01MPa
第四，国产微波消解系统可同时处理同一批次10个以上的样品。
第五，安全膜片的保护压力中压为200psi，高压为400psi。
六、微波消解系统通过PID控制改变微波频率来调节不同的输出功率，提高了电源部分的效率，降低了待机时的消耗，比传统微波炉省电20%以上。此外，变频技术的引入也降低了仪器的工作噪音。