整个操作过程需要在净化台中进行，要求洁净度100；其次，要按照相关示意图安装好过滤头，消毒备用。待检样品溶解于灭菌容积后，吸入灭菌注射器，Z后注入过滤器的玻璃筒内，与仪器底座一起培养，也可将过滤器头与底座分离培养。
有些用户的保温箱容量有限，也可以采用以下操作方法:从底座上拔出已排干试液的过滤头，在过滤头下端的螺纹管排水口处塞上橡胶套塞。然后将过滤头和底座分别放入培养箱中培养。
微生物限度检查仪的功能特点:
1.它可以检测固体、液体、表面、糊状和浆状样品；
2、检测时样品不需要任何预处理过程，可直接投入摇瓶中；
3、检测样品仅需1ml/1g；可以在同一温度下同时检测六个样品；
4.灵敏度高，可检测1种目标微生物；特异性高达99.999%；
5、简单的三个操作步骤，傻瓜式，无需操作人员；
6、便携式仪器，可直接连接电脑进行定量分析和检测报告，可随时随地进行检测和定量分析。
7.测试瓶在使用后被安全丢弃——与过期药物一样。