苗塞的颜色会影响植物根部的温度。白色发泡胶盘反射性好，多用于夏秋季的早期育苗，以反射光线，减少幼苗根部的热量积累。冬春季节选择黑色秧盘，因其吸光性好，有利于秧苗根系的绿色化。幼苗长大后，要开始使用控根快速育苗技术，移入控根快速育苗容器继续生长。
育苗，由于幼苗抗逆性增强，种植不损伤根系，如果幼苗裸根往往会影响成活率，而穴盘育苗属于带块移栽，所以大田种植后，幼苗延迟快，成活率高。
穴盘育苗采用精量播种，一次成苗，自动控制混基质、装盘、播种、覆盖等一系列操作。苗龄比常规育苗缩短10-20天，劳动效率提高5-7倍。常规育苗人均管理2.5万株，穴盘育苗15万株。由于机械化作业管理程度高，降低了工作强度和工作量。常规育苗每块土平均重0.5-0.75公斤，每公顷蔬菜(平均6万株)相当于移土30-45吨，而穴盘育苗采用轻型基质，种植时每株苗仅重35-50克。
播种在穴盘里，让幼苗在穴盘里生长，长大后再移入苗盆，或开沟分苗，或大田种植；播种于秧盘，将秧苗移入穴盘，长大后移入秧碗，或开沟分秧，或种植；这种方式一开始占地少，特别适合早春气温低的时候育苗，等外界气温升高后再转移到其他保护区育苗，可以降低取暖成本。如果没有种植较大的幼苗，可以直接用穴盘苗培育。
穴盘育苗是干种直播，一穴一种，集中育苗。万株苗耗煤量是常规苗的25% ~ 50%，节约能源2/3。单位面积苗数高于常规苗。按每盘穴数，每公顷可育苗315万~ 1080万株。使用穴盘育苗可以有效增加保护地的生产面积。
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